快！更省！高通量核酸片段化分析系统——LabChip GX Touch

来源：MomoBioMaster

作者：双墨生物

在全球生物医药产业发展快速上升的时期，疫情时代的医药产业迎来了新一轮的变革，细胞与基因治疗的药物被认为是未来医药领域发展的潜力，成为当今增速最快的创新药物领域之一。国家药监局对这一领域的发展高度重视，为规范和指导体内基因治疗产品的药学研发、生产和注册，于今年5月31日，在国家药品监督管理局的部署下，药审中心发布了《体内基因治疗产品药学研究与评价技术指导原则（试行）》。

该《指导原则》明确规定，“生产若使用了肿瘤细胞系（如Hela细胞）、 致瘤细胞系，或携带有致瘤基因、病毒来源序列的细胞（如HEK 293T细胞）， 在确保无完整活细胞残留的同时，需对DNA的残留量和残留片段大小进行控制，合理拟定标准限度。如有可能，建议尽量将残留DNA控制在10 ng/剂以内，DNA残留片段的大小控制在200 bp以下”。

这是国内的指导原则首次将风险性DNA残留片段的大小控制在200 bp以下进行明文规定，其实早在2010年FDA发布的生物制品相关指导中，就有强调根据不同细胞系来源和遗传背景需要，可通过降低残留DNA的含量、减小残留DNA片段的大小（如DNase或其他办法处理）至功能基因大小以下，在终产品中需要检测残留DNA的含量和片段大小分布情况。现有研究表明，一个功能基因至少在200 bp以上，因此，为减少残留DNA风险，FDA建议残留 DNA 片段不大于200 bp。DNA片段大小风险等级如下表：

那么，宿主细胞残留 DNA 片段大小应该用什么技术平台进行检测呢？

LabChip

Genomic Research

性能卓越的自动化电泳服务于基因组研究

LabChip® GX Touch微流体技术简化了平板电泳的诸多人工步骤，并提供对基因组研究，无论是PCR前还是PCR后的工作流程都至关重要的样品完整性及其他各项全面质控。

采用便捷的触摸屏界面，即使是临时用户都可很快上手，方便准备和运行样品。

01LabChip GX Touch提供

◈触屏点击式快速样品分析‒仅需30秒/样品

◈量化评价RNA和DNA样品完整性，确保只有优质的样品用于下游分析检测

◈最高批处理通量24个样品的高效平台节约时间和试剂用量；最高批处理通量384个样品的型号则适用于高通量工作流程

◈数据输出选项：电泳峰图、虚拟胶图或数据表格形式

无论您的测序实验室需要分析稀缺和珍贵样品，还是运行PCR-free的流程，亦或是需要对样品中的每个片段定量以进行基因分型分析，方便易用、成本低、通量高且灵活的LabChip GX Touch系列可以极大地减轻分析日益增多的样品的负担。

02LabChip GX触摸屏简化了样品的分析

数据分析从一个易于使用的触摸屏界面开始

灵活的数据选项允许多种格式的实时查看或导出

Touch — 人性化操作

◈加载样品板和芯片

◈选择样品（一次最多运行384个样品）

◈选择实验类型

◈触点“ 运行”，开始实验

◈您甚至可以让系统自动将数据直接导出到您的网络或LIMS系统

运行 — 实时观察运行

◈样品分析耗时少至 30 秒

◈数据采集过程中电泳峰图实时可见

◈在运行环境中将采集到的数据叠加比较样品谱式

◈挑选不同运行时间分析特征注释

回顾 — 实时查看数据或导出以待日后分析

◈选择以电泳峰图、虚拟胶图或数据表格形式显示

◈使用TIBCO Spotfire®数据可视化软件强化分析结果

◈收集选择多板样品的数据进行平行分析比对

◈挑选过滤具备关键属性应用的数据

◈突出显示目标峰谱

03只将高质量的核酸样品送到下游

电泳分析是二代测序文库质控的重要环节，它可同时提供每个样品的片段大小以及定量信息。

LabChip GX Touch可以自动完成DNA和 RNA 片段以及smear样品的片段大小和浓度分析，用于测序的文库样品的质控。片段样品分析通常用于交叉检验片段化或者PCR步骤的效果。文库样品的DNA总量分析均一化步骤。

节约样品

LabChip可以对浓度低至2.5 pg/μL的smear以及0.5 pg/μL的片段进行准确定量，实现对稀缺和珍贵样品的快速分析（搭配对应试剂盒）。

上图显示了DNA NGS 3K检测样品的灵敏度。同一NGS文库样品进行6次3倍系列稀释，实验结果展示了 LabChip DNA NGS 3K检测样品浓度下限。数据结果在LabChip GX Touch仪器上展示。

快速分析RNA

LabChip Touch平台提供了易于理解的RNA浓度以及核糖体RNA的比例，与RNA质量评分（RQS）共同用作完整性评价指标。

除RQS值外，分析软件现在可以自动计算DV200 值。这两个值可以导出，并用于确定来自诸如 FPE 标本的 RNA 样品的质量。

RNA 电泳图谱，其中展示 18S 和 28S 峰

基因组DNA样品降解评分

为Labchip GX Touch系统开发的基因组DNA实验创新性的引入了基因组DNA质量评分 （GQS），替代传统的凝胶电泳。所提供的电子数据，兼容实验室信息管理系统、可以轻松归档和分发。可在30-60秒内快速分析25-12000 bp的DNA样品 （对于gDNA完整性检测上限可达40000 bp）。

以电泳图谱展示的基因组 DNA 质量评估

Small RNA分析

LabChip小RNA试剂盒能够快速分离和测定多种片段范围在20至150核苷酸之间的小RNA样品，包括miRNA、SiRNA、PiRNA、tRNA 以及CRISPR-gRNA。这个全新的小RNA分析方法可快速自动分析小RNA片段大小和相对丰度从而可以达到节省时间和成本。LabChip微流控毛细管电泳技术能够在一分钟内自动分离和分析小RNA样品。系统软件自动分析数据，通过采用内部参考品 和标准品来确定小RNA样品的片段大小和浓度 。

LabChip小RNA检测方法可自动测定小RNA样本的片段片段大小，具有很高的准确度和精密度。